Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HERVK_113Q902F9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms