Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYQ5

DGCR8, Microprocessor complex subunit DGCR8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DGCR8Q8WYQ5 SDR39U1-221ENST00000556707 1196 ntTSL 223.62■■□□□ 1.372e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.352e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 SDR39U1-209ENST00000554947 1203 ntTSL 223.43■■□□□ 1.342e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 SMDT1-202ENST00000422252 591 ntTSL 223.28■■□□□ 1.322e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.212e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.182e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.122e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.092e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 NELFE-211ENST00000492185 1786 ntTSL 221.26■□□□□ 0.992e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.972e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.972e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.942e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 STK25-214ENST00000436917 499 ntTSL 420.89■□□□□ 0.932e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 STK25-227ENST00000483603 572 ntTSL 520.89■□□□□ 0.932e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.932e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.912e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 STK25-210ENST00000426941 575 ntTSL 220.68■□□□□ 0.92e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 STK25-219ENST00000452891 575 ntTSL 420.68■□□□□ 0.92e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.892e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.892e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 SDR39U1-204ENST00000553343 681 ntTSL 220.48■□□□□ 0.872e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 RPAIN-210ENST00000571613 1688 ntTSL 220.48■□□□□ 0.872e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.19■□□□□ 0.822e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.772e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 NELFE-208ENST00000481121 1543 ntTSL 219.71■□□□□ 0.752e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 STK25-207ENST00000420551 395 ntTSL 519.69■□□□□ 0.742e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 SDR39U1-218ENST00000556262 1960 ntTSL 219.59■□□□□ 0.732e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 SDR39U1-216ENST00000556175 775 ntTSL 319.5■□□□□ 0.712e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 PLEC-211ENST00000527303 598 ntTSL 319.48■□□□□ 0.712e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.72e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 SDR39U1-220ENST00000556548 2336 ntTSL 219.26■□□□□ 0.672e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 STK25-213ENST00000436402 600 ntTSL 519.19■□□□□ 0.662e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.642e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.582e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 SDR39U1-203ENST00000544691 1507 ntTSL 1 (best)18.63■□□□□ 0.572e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 STK25-232ENST00000495372 561 ntTSL 218.58■□□□□ 0.562e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.562e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 SLC25A25-207ENST00000466983 905 ntTSL 518.42■□□□□ 0.542e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 SDR39U1-210ENST00000555225 769 ntTSL 318.41■□□□□ 0.542e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 RPAIN-208ENST00000571043 1547 ntTSL 218.37■□□□□ 0.532e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.532e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 STK25-217ENST00000442307 923 ntTSL 218.24■□□□□ 0.512e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.492e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.462e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 NFE2L1-205ENST00000577411 562 ntTSL 517.87■□□□□ 0.452e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 NFE2L1-211ENST00000580050 476 ntTSL 417.87■□□□□ 0.452e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 NFE2L1-206ENST00000577431 583 ntTSL 517.87■□□□□ 0.452e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 STK25-211ENST00000429279 580 ntTSL 417.85■□□□□ 0.452e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 SBF1-203ENST00000399627 811 ntTSL 517.59■□□□□ 0.412e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 CARM1-203ENST00000586221 2766 ntTSL 1 (best)17.44■□□□□ 0.382e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.382e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 NFE2L1-220ENST00000584634 588 ntTSL 417.23■□□□□ 0.352e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.272e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.231e-12■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.212e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.182e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.172e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 SDR39U1-219ENST00000556523 735 ntTSL 316.12■□□□□ 0.172e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.132e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.122e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 SDR39U1-217ENST00000556249 556 ntTSL 315.64■□□□□ 0.092e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.092e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.092e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.062e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 ST3GAL3-228ENST00000495482 887 ntTSL 215.18■□□□□ 0.022e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 02e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 RPAIN-206ENST00000539417 1471 ntTSL 215.07■□□□□ 02e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 TPCN1-218ENST00000551127 2975 ntTSL 215.03■□□□□ -02e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.012e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 GUSBP11-202ENST00000430357 696 ntTSL 315□□□□□ -0.012e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.022e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 GNA12-208ENST00000496740 2450 ntTSL 214.88□□□□□ -0.032e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 SDR39U1-215ENST00000555830 418 ntTSL 314.75□□□□□ -0.052e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.082e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 NFE2L1-217ENST00000583210 512 ntTSL 414.53□□□□□ -0.082e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.092e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.12e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 STK25-216ENST00000440109 935 ntTSL 314.37□□□□□ -0.112e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.182e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 SLC25A25-205ENST00000432073 3678 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.22e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 RPAIN-209ENST00000571558 1423 ntTSL 213.76□□□□□ -0.212e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 SLC25A25-204ENST00000373069 3376 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 ST3GAL3-226ENST00000490502 592 ntTSL 313.7□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 ASB3-211ENST00000482829 1910 ntTSL 513.64□□□□□ -0.232e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 NFE2L1-222ENST00000585291 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.242e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 MORC3-206ENST00000492336 1290 ntTSL 1 (best)13.41□□□□□ -0.262e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 SLC25A25-203ENST00000373068 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.262e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 SFXN5-204ENST00000416579 895 ntTSL 313.32□□□□□ -0.282e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 SDR39U1-211ENST00000555355 934 ntTSL 213.32□□□□□ -0.282e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 NELFE-209ENST00000488426 1855 ntTSL 513.27□□□□□ -0.282e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 NFE2L1-203ENST00000362042 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.292e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 YME1L1-208ENST00000491542 912 ntTSL 213.19□□□□□ -0.32e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 GNA12-205ENST00000471281 1205 ntTSL 313.18□□□□□ -0.32e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 RPAIN-213ENST00000573577 1282 ntTSL 213.18□□□□□ -0.32e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.32e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 KCTD19-210ENST00000569333 4913 ntTSL 213.02□□□□□ -0.332e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 NR1H4-202ENST00000321046 1779 ntTSL 1 (best)12.99□□□□□ -0.332e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.332e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.332e-7■■■■■ 32.7
DGCR8Q8WYQ5 ASLP1-201ENST00000428790 637 ntBASIC12.93□□□□□ -0.342e-7■■■■■ 32.7
Retrieved 100 of 22,183 protein–RNA pairs in 100.9 ms