RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551127.5

TPCN1-218, Transcript of two pore segment channel 1, humanhuman

TSL 2

Gene TPCN1, Length 2,975 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1-218ENST00000551127 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.75■■■□□ 2.03
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TPCN1-218ENST00000551127 ABCC9O60706 1549 aa23.27■■□□□ 1.31
TPCN1-218ENST00000551127 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
TPCN1-218ENST00000551127 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.24■■□□□ 1.31
TPCN1-218ENST00000551127 HRCP23327 699 aa22.89■■□□□ 1.25
TPCN1-218ENST00000551127 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.64■■□□□ 1.21
TPCN1-218ENST00000551127 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.5■■□□□ 1.19
TPCN1-218ENST00000551127 SCRIBQ14160 1630 aa22.48■■□□□ 1.19
TPCN1-218ENST00000551127 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
TPCN1-218ENST00000551127 NACADO15069 1562 aa22.4■■□□□ 1.18
TPCN1-218ENST00000551127 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.35■■□□□ 1.17
TPCN1-218ENST00000551127 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.29■■□□□ 1.16
TPCN1-218ENST00000551127 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.26■■□□□ 1.15
TPCN1-218ENST00000551127 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
TPCN1-218ENST00000551127 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
TPCN1-218ENST00000551127 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
TPCN1-218ENST00000551127 UNC13AQ9UPW8 1703 aa21.95■■□□□ 1.1
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TPCN1-218ENST00000551127 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
TPCN1-218ENST00000551127 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
TPCN1-218ENST00000551127 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.6■■□□□ 1.05
TPCN1-218ENST00000551127 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.59■■□□□ 1.05
TPCN1-218ENST00000551127 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
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TPCN1-218ENST00000551127 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
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TPCN1-218ENST00000551127 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
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TPCN1-218ENST00000551127 PEG3Q9GZU2 1588 aa20.88■□□□□ 0.93
TPCN1-218ENST00000551127 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa20.85■□□□□ 0.93
TPCN1-218ENST00000551127 DNAJC5BQ9UF47 199 aa20.81■□□□□ 0.92
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TPCN1-218ENST00000551127 NCAPD3P42695 1498 aa20.76■□□□□ 0.91
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TPCN1-218ENST00000551127 TNIKQ9UKE5 1360 aa20.24■□□□□ 0.83
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TPCN1-218ENST00000551127 CLSPNQ9HAW4 1339 aa20.16■□□□□ 0.82
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TPCN1-218ENST00000551127 CUX1P39880 1505 aa20.14■□□□□ 0.82
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TPCN1-218ENST00000551127 PRDM2Q13029 1718 aa20.03■□□□□ 0.8
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TPCN1-218ENST00000551127 CEP164Q9UPV0 1460 aa19.99■□□□□ 0.79
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TPCN1-218ENST00000551127 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
TPCN1-218ENST00000551127 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19.94■□□□□ 0.78
TPCN1-218ENST00000551127 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP19.92■□□□□ 0.78
TPCN1-218ENST00000551127 TOPBP1Q92547 1522 aa19.91■□□□□ 0.78
TPCN1-218ENST00000551127 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.78
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TPCN1-218ENST00000551127 ERCC6Q03468 1493 aa19.87■□□□□ 0.77
TPCN1-218ENST00000551127 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
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TPCN1-218ENST00000551127 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
TPCN1-218ENST00000551127 KIF27Q86VH2 1401 aa19.81■□□□□ 0.76
TPCN1-218ENST00000551127 ANP32EQ9BTT0 268 aa19.8■□□□□ 0.76
TPCN1-218ENST00000551127 VPS8Q8N3P4 1428 aa19.8■□□□□ 0.76
TPCN1-218ENST00000551127 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa19.8■□□□□ 0.76
TPCN1-218ENST00000551127 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa19.78■□□□□ 0.76
TPCN1-218ENST00000551127 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.75
TPCN1-218ENST00000551127 CLIP1P30622 1438 aa19.75■□□□□ 0.75
TPCN1-218ENST00000551127 MRC2Q9UBG0 1479 aa19.71■□□□□ 0.75
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