Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC99

FNDC8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC8Q8TC99 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FNDC8Q8TC99 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC8Q8TC99 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC8Q8TC99 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC8Q8TC99 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC8Q8TC99 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC8Q8TC99 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC8Q8TC99 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC8Q8TC99 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC8Q8TC99 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC8Q8TC99 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC8Q8TC99 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC8Q8TC99 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC8Q8TC99 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC8Q8TC99 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC8Q8TC99 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC8Q8TC99 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC8Q8TC99 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC8Q8TC99 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC8Q8TC99 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC8Q8TC99 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC8Q8TC99 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC8Q8TC99 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC8Q8TC99 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC8Q8TC99 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC8Q8TC99 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC8Q8TC99 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC8Q8TC99 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC8Q8TC99 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC8Q8TC99 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC8Q8TC99 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC8Q8TC99 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC8Q8TC99 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC8Q8TC99 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC8Q8TC99 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC8Q8TC99 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC8Q8TC99 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC8Q8TC99 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC8Q8TC99 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC8Q8TC99 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC8Q8TC99 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC8Q8TC99 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC8Q8TC99 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC8Q8TC99 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC8Q8TC99 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC8Q8TC99 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC8Q8TC99 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FNDC8Q8TC99 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms