Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFP9

NBEA, Neurobeachin, humanhuman

Predictions only

Length 2,946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBEAQ8NFP9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NBEAQ8NFP9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NBEAQ8NFP9 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NBEAQ8NFP9 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NBEAQ8NFP9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NBEAQ8NFP9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NBEAQ8NFP9 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NBEAQ8NFP9 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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NBEAQ8NFP9 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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NBEAQ8NFP9 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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NBEAQ8NFP9 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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NBEAQ8NFP9 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NBEAQ8NFP9 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NBEAQ8NFP9 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NBEAQ8NFP9 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NBEAQ8NFP9 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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NBEAQ8NFP9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NBEAQ8NFP9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NBEAQ8NFP9 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NBEAQ8NFP9 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NBEAQ8NFP9 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NBEAQ8NFP9 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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NBEAQ8NFP9 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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NBEAQ8NFP9 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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NBEAQ8NFP9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NBEAQ8NFP9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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NBEAQ8NFP9 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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NBEAQ8NFP9 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NBEAQ8NFP9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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NBEAQ8NFP9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NBEAQ8NFP9 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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NBEAQ8NFP9 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NBEAQ8NFP9 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NBEAQ8NFP9 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NBEAQ8NFP9 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NBEAQ8NFP9 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NBEAQ8NFP9 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NBEAQ8NFP9 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NBEAQ8NFP9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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