Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ANKRD53Q8N9V6 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ANKRD53Q8N9V6 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms