Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN19Q8N6F1 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN19Q8N6F1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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