Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC103Q8IW40 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC103Q8IW40 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms