Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRCQ7RTU9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms