Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LINC00299Q6ZSB3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms