Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TSSK4Q6SA08 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms