Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRT80Q6KB66 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRT80Q6KB66 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms