Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RNF123Q5XPI4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF123Q5XPI4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF123Q5XPI4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF123Q5XPI4 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF123Q5XPI4 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF123Q5XPI4 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF123Q5XPI4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF123Q5XPI4 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF123Q5XPI4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RNF123Q5XPI4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF123Q5XPI4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF123Q5XPI4 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF123Q5XPI4 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF123Q5XPI4 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF123Q5XPI4 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RNF123Q5XPI4 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms