Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
WDR44Q5JSH3 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms