Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SFT2D3Q587I9 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SFT2D3Q587I9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms