Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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