Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP20-2Q3LI61 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms