Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Q1T7F1 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
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