Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IMPG1Q17R60 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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