Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RPE65Q16518 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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