Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCDC6Q16204 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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