Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZNF56Q15929 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms