Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SCN9AQ15858 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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