Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
USF2Q15853 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USF2Q15853 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USF2Q15853 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USF2Q15853 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USF2Q15853 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USF2Q15853 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USF2Q15853 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USF2Q15853 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USF2Q15853 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USF2Q15853 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
USF2Q15853 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USF2Q15853 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USF2Q15853 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USF2Q15853 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USF2Q15853 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USF2Q15853 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USF2Q15853 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USF2Q15853 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USF2Q15853 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USF2Q15853 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USF2Q15853 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USF2Q15853 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
USF2Q15853 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USF2Q15853 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USF2Q15853 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
USF2Q15853 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USF2Q15853 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USF2Q15853 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USF2Q15853 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USF2Q15853 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USF2Q15853 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USF2Q15853 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USF2Q15853 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USF2Q15853 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USF2Q15853 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USF2Q15853 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USF2Q15853 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USF2Q15853 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USF2Q15853 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USF2Q15853 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USF2Q15853 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USF2Q15853 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USF2Q15853 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
USF2Q15853 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USF2Q15853 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USF2Q15853 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
USF2Q15853 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
USF2Q15853 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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