Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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VAMP3Q15836 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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VAMP3Q15836 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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VAMP3Q15836 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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VAMP3Q15836 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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VAMP3Q15836 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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VAMP3Q15836 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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VAMP3Q15836 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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VAMP3Q15836 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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VAMP3Q15836 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VAMP3Q15836 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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