Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCOA1Q15788 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms