Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TAF1AQ15573 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
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