Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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