Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NECTIN1Q15223 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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NECTIN1Q15223 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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NECTIN1Q15223 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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NECTIN1Q15223 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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NECTIN1Q15223 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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NECTIN1Q15223 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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NECTIN1Q15223 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NECTIN1Q15223 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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