Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAM2Q15035 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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