Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB39AQ14964 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms