Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
HNF4GQ14541 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms