Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GTF2H3Q13889 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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