Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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