Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LAMC2Q13753 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms