Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATP1A4Q13733 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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