Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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SP140Q13342 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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SP140Q13342 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SP140Q13342 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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SP140Q13342 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SP140Q13342 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SP140Q13342 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SP140Q13342 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SP140Q13342 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SP140Q13342 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SP140Q13342 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SP140Q13342 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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