Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SRSF5Q13243 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms