Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GRIK2Q13002 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms