Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms