Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

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Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
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KCNMA1Q12791 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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KCNMA1Q12791 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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KCNMA1Q12791 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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KCNMA1Q12791 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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KCNMA1Q12791 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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KCNMA1Q12791 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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KCNMA1Q12791 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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KCNMA1Q12791 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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KCNMA1Q12791 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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