Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CD300CQ08708 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms