Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PDE4DQ08499 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE4DQ08499 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms