Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLGA3Q08378 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms