Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DHX9Q08211 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms