Protein–RNA interactions for Protein: Q05823

RNASEL, 2-5A-dependent ribonuclease, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNASELQ05823 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNASELQ05823 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RNASELQ05823 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNASELQ05823 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNASELQ05823 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNASELQ05823 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNASELQ05823 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNASELQ05823 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNASELQ05823 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNASELQ05823 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNASELQ05823 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNASELQ05823 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNASELQ05823 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RNASELQ05823 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNASELQ05823 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNASELQ05823 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNASELQ05823 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNASELQ05823 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNASELQ05823 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNASELQ05823 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNASELQ05823 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNASELQ05823 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms