Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GRIN1Q05586 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms