Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARID5AQ03989 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARID5AQ03989 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms