Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLCB3Q01970 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLCB3Q01970 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms