Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK3Q00526 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms